战胜曼德斯的瑞一行人来到联合军基地小镇，结果小镇被GA-18炸毁；一行人又逃到变种人部落，结果变种人部落被耶梦加得毁灭；最终一行人冲上阿斯加特展开最终大战，一场世纪较量之后，以阿斯加特的坠落落下了战争的帷幕然而，这却只是一场阴谋的开始……《纳米核心第2季》故事主线却是相当成熟的，动漫围绕暖暖的温情为核心，整体充满了励志正能量的感动，配音是这部动画电影成功的关键，影片的设计美妙到让人着迷。画风娴熟完美，角色设计层次与细节分明，剧情充满励志的正能量，特效真诚而不浮夸，是一部点燃情感以及富有活力的动画片。