1948年初，青城发生了一起美军被刺杀案件，特调局要员俞北平（陈建斌饰）被派往青城调查此案他深知特调局委派自己调查此案的深层目的，旨在甄别自己的身份。深陷危机的俞北平在青城见到失散多年的亲生女儿。女儿身份神秘，正在调查自己。俞北平与现任妻子的女儿徐丹妮在青城上大学，思想左倾，对父亲特务身份嗤之以鼻，正爱着一名有家室的教授，让俞北平很苦恼。俞北平一方面要完成组织最高任务，一方面小心翼翼保护着自己的两个女儿。最终，大女儿为保护他而牺牲，小女儿直到和父亲分离，才恍然明白：父亲是一名真正的共产党员。但从此两人却永隔天涯。《父亲的身份DVD版》讲述了男女主一见钟情，二人在相处中甜蜜碰撞，上演一场高智商与高情商的甜萌梦幻爱情故事，本剧男女主两人从欢喜冤家到相濡以沫，其他支线剧情也没有太多的“狗血”情节，他们决意勇敢面对婚姻中的一切，拥抱更好的彼此，因其细腻动情的表现，引起了大批观众的共鸣。