外表长得像女孩一样可爱的少年二鸟修一，渴望自己能够变成真正的女孩，而长得像男孩一样酷帅的少女高槻佳乃，则是希望自己能够变成男孩两个人在修一的朋友千叶的推波助澜之下发现了对方的秘密，之后更瞒着大家到远一点的城镇交换身分——修一穿着女装，佳乃则打扮成男生的样子。起初，因为大家还是小学生，所以这种“性别交换”还能很顺利地进行下去，但随著两人的成长，却慢慢地浮现出各种各样的问题……《幼崽养成记》故事主线极具东方特色，动漫保持一颗纯真的童心为核心，整体充满了丰富的时代主题，配音惟妙惟肖，影片的设计相当真实。画风使人大开眼界，角色设计创意令人惊叹，剧情情节连贯、紧凑，张弛有度，特效创意无比，又充满想象力，是一部跨越时空、纵横想象的动画片。